既然在通往終末的「拯救史」中，上帝賜給信徒聖靈作為「擔保」和「記號」，以保證終末拯救的到來，那麼，聖靈最重要的工作，就是「陪伴」信徒走過這段終末的上帝國「已經」開始，但是「尚未」完成的時期。然而，聖靈如何工作呢？
約翰福音十四章16-17節說：「我要祈求父親，他就賜給你們另一位慰助者，永遠跟你們同在。他就是真理的靈。……」
十四章26節又說：「但是那慰 助者，就是父親因著我的名要差來的聖靈，會把一切的事指示你們，並且使你們記起我對你們所說過的一切話。」
從這兩段經文可以看出，聖靈的工作就是籾作為 「慰助者」，陪伴信徒走過耶穌「不在」的這段時間；祂作為「真理的靈」，教導信徒認識「真理」，也就是讓他們記起耶穌曾經教導過他們的話，讓他們知道如何 走向終末。
「慰助者」的原意是指「法庭上的法律顧問」，類似今天的「律師」，其職責是在法庭上為人辯護，以便讓人得到法律上的幫助。因為耶穌的「復活」和「昇天」是「終末」的開始，所以當約翰說，在耶穌復活之後，上帝要差遣聖靈做為信徒的「法律顧問」時，他的意思是說：當終末臨到時，所有的人將面臨一個大審判，而在這個大審判的法庭中，聖靈將成為信徒的「法律 顧問」，幫忙信徒順利通過審判，以便得到最後的拯救。
而聖靈在終末的法庭上為信徒辯護，做為信徒的「法律顧問」的方法，不是狡辯，也不是縱容，更不是顛倒是非，而是在平時就教導信徒認識真理，並且賜給 他們力量去遵行真理，最後信徒在終末的法庭上就自然而然地可以通過審判，得到終末的拯救。這就是約翰福音十四章16-17節稱呼「聖靈」為「真理的靈」， 在十四章26節又說：「但是那慰助者，就是父親因著我的名要差來的聖靈，會把一切的事指示你們，並且使你們記起我對你們所說過的一切話」的原因。
保羅在哥林多前書六章7-11節說：「……難道你們不知道邪惡的人不能做上帝國的子民嗎？不要欺騙自己呀！凡是淫亂……或勒索人的，都不能做上帝國 的子民。你們當中，有些人從前正是這樣。但是，藉著主耶穌基督的名和我們上帝的靈，你們已經被洗淨，已經被聖化歸上帝，已經得以跟上帝和好了。」
保羅的意思是說：邪惡的人不能進上帝國，也就是不能得到終末的拯救，為了解決這個困境，「聖靈」在今天要做的工作，就是帶領信徒「被洗淨」、「被聖化歸上帝」以便 「跟上帝和好」。
「被洗淨」的原文在新約裡只出現兩次，另外一處是在使徒行傳廿二章16節：「那麼，你還耽擱什麼呢？起來，呼求他的名，領受洗禮，好『潔淨』你的罪！」
在這段經文裡，「潔淨」指洗淨先前所犯的罪，而且和「洗禮」放在一起，所以在新約裡，「潔淨」是指藉著洗禮洗去先前所犯的罪，然後成為基督徒，開始一個全新的生命。也因此，保羅在哥林多前書六章11節提到「被洗淨」，他的意思是說：為了帶領信徒在終末時可以得救進入上帝國，聖靈在今天就帶領信徒「信」耶穌，同時接受洗禮，以便洗去先前的罪，並且加入基督徒的團契裡，天天過著跟隨耶穌的生活，這樣在終末的審判中，自然就能順利地通過審判，並且得到終末的拯救。
藉著洗禮洗淨罪惡，然後加入教會成為基督徒，就是「被聖化歸上帝」的意思。「被聖化歸上帝」的原文是「被聖化」，意思是成為專屬於上帝的百姓，成為 基督徒就是成為專屬於上帝的百姓。
出埃及記十九章4-6節說：「你們已經看見我－－上主怎樣對付埃及人。我背著你們，正像母鷹把小鷹背在翅膀上，把你們帶到這裡歸我自己。如果你們服從我， 守我的約，你們就是我的子民。全世界都屬於我，但只有你們是我的選民，是神聖的國民，是事奉我的祭司。」
這段經文的意思是說：上帝藉著出埃及的拯救事件揀 選了以色列，從此以後，以色列人成為專屬於上帝的「選民」，也就是「神聖的國民」；當「神聖的國民」的「福利」是可以繼續領受上帝的拯救，「義務」是除了必須服從上帝的誡命，遵守他們和上帝所訂立的契約外，也要像祭司那樣事奉上帝。這樣的誡命在當時還有一個很特別的意義，就是既然選民是「專屬於上帝」的國民，他們就不能再屬於其他的人或神明，所以以色列人不能拜巴力，也不能臣服於任何國家，而這些都是以色列人在歷史中所犯的滔天大罪，也是十誡要把「我以外，你不可敬拜別的神明」（出埃及記廿章2節）放在第一誡的原因。
回到哥林多前書六章11節，保羅說「聖靈」的工作之一就是讓信徒「被聖化歸上帝」，他所要見證的信息是：為了讓信徒在終末的法庭上可以通過審判，聖 靈在信徒的日常生活中引導他們，讓他們悔改信耶穌，並藉著洗禮洗去罪惡，然後加入基督徒的團契，成為專屬上帝的子民，在每天的生活中遵守上帝的誡命，在各 種工作和職分上事奉上帝，這樣的信徒可以通過終末的審判；而這就是聖靈在終末的法庭上作信徒「法律上的顧問」的方法。
「跟上帝和好」的原文是「被稱為義」，這是聖靈當信徒的保惠師，幫助信徒在日常生活中「被洗淨」、「被聖化歸上帝」的結果。「義」的原意是「照著所 規定的去做」，在聖經裡，「規定」指的是上帝的誡命，又因為以色列人認為律法就是上帝的誡命，所以在舊約裡，遵守律法就是「義」的表現，而「義」的結果就 是「被稱為義」，和「得救」是同樣的意思。11 可見，保羅相信：聖靈幫助信徒「被洗淨」、「被聖化歸上帝」的結果，就是得救「被稱為義」。
接著，保羅以「聖靈的殿」的觀念，來發展上述聖靈引導信徒「被洗淨」、「被聖化歸上帝」，最後「被稱為義」的主題。保羅在哥林多前書六章19-20 節說：「你們不知道你們的身體就是聖靈的殿嗎？這聖靈住在你們裡面，是上帝所賜的。你們不屬於自己，而是屬上帝，因為他用重價買了你們。所以，你們要用身 體來榮耀上帝。」
保羅的意思是說：一個信徒藉著洗禮被洗淨成為基督徒之後，他就被聖化歸上帝了；而為了標明這個信徒是專屬於上帝的，上帝就賜給他「聖靈」 作為印記，以標示出這是一個屬上帝的信徒。
「聖靈的殿」和「上帝的殿」的觀念是相通的。保羅在哥林多前書三章16節說：「你們一定曉得，你們是上帝的殿，上帝的靈住在你們裡面。」
保羅的意思 是說：因為聖靈住在你們裡面，所以你們是「上帝的殿」，就好像耶路撒冷的聖殿那樣。在哥林多後書六章16節，保羅也說：「上帝的殿和偶像怎能並立呢？我們 是永生上帝的聖殿。正如上帝說：『我要跟我的子民同住，在他們當中往來。我要作他們的上帝；他們要做我的子民。』」
上帝作百姓的上帝，和祂的子民同住，這 些因素使信徒成為「上帝的殿」。所以，信徒是「上帝的殿」，因為有上帝的靈住在他們裡面，成為他們的保惠師，將真理啟示在信徒心裡，並且賜給他們力量去遵 行這些誡命，因此，信徒的日常生活可以成為活的祭物，奉獻在上帝面前，也因為如此，信徒的身體就成為「上帝的殿」。
信徒是「聖靈的殿」或「上帝的殿」的觀念，可以遠溯自以西結卅六章25-27節：「我要用清潔的水灑你們，洗掉你們一切的污穢，除掉你們所有的偶像。我要 賜給你們新的心、新的靈。我要替你們換心，把像石頭一樣堅硬的心除掉，換上一顆有血有肉、肯服從的心。我要把我的靈賜給你們，使你們能夠遵行我的法律，服 從我的誡命。」
在以西結的時代，以色列人已經因為犯罪而被上帝懲罰，部分的人民已經被擄在巴比倫。這時候，先知以西結宣佈上帝的憐憫說：上帝要再次拯救我 們，因為我們被擄的原因是犯罪，所以要得到上帝的拯救的必要條件是人民要悔改；而在這件事上，上帝很樂意幫助百姓，所以祂願意改造百姓，賜給他們新的心和 新的靈，讓他們可以悔改，也就是揚棄先前不順服的心，改為願意遵行上帝的律法和誡命的心；然後，在百姓悔改之後，上帝的拯救自然會再次臨到百姓。
所以，當保羅說信徒是「聖靈的殿」或「上帝的殿」時，他所要強調的是：為了幫助信徒通過終末的審判，為了完成在終末的法庭中作信徒的「法律顧問」的任務，聖靈進入信徒的心，使信徒的身體成為聖靈所居住的殿，然後開始改造信徒，讓信徒可以在日常生活中去除不順服上帝的罪，並且領受聖靈所啟示的真理，遵守上帝的誡命，使信徒成為屬於上帝的百姓，這種百姓在終末的審判中，自然可以得到上帝的拯救。
「聖靈」就是「上帝」本身，聖經在「上帝」之外又提到「聖靈」，目的在於強調「聖靈」在拯救史中的工作。
耶穌的道成肉身、復活和昇天已經開啟了終末的盼望，所有的人都必須準備好面對終末的審判。聖靈的工作，就是做為信徒將來得救的擔保和印記，保證信徒 在終末來臨時可以得救；這也就是說，聖靈要作為信徒的保惠師，在將來終末審判的法庭上作信徒的幫助，協助他們通過審判；而聖靈工作的方法，是在今天陪伴著信徒，藉著啟示真理，讓信徒認識上帝和祂的旨意，也藉著賜給力量，引導信徒遵行上帝的誡命；在聖靈這樣工作之後，信徒就可以離開不順服上帝的罪，可以被洗淨，可以被聖化歸於上帝，可以成為聖靈的殿，可以坦然面對終末的審判，並且可以篤定通過終末的審判，得救進入上帝國。
